研究發(fā)現(xiàn),大部分白血病患者細(xì)胞中存在異常的融合基因UBA2-WTIP,可作為檢測(cè)白血病的特異性分子標(biāo)志物??蒲腥藛T通過(guò)RT-PCR方法克隆得到融合基因UBA2-WTIP,為了研究該基因的作用和致病機(jī)制,需要構(gòu)建重組載體并把目的基因和FLAG標(biāo)簽基因序列連接起來(lái),分別獲得帶有FLAG肽鏈的UBA2-WTIP融合蛋白和WTIP蛋白。FLAG肽鏈由8個(gè)氨基酸殘基組成,可作為基因工程中蛋白質(zhì)是否表達(dá)的標(biāo)記。
(1)科研人員以提取的某白血病人外周血細(xì)胞總RNA為模板,經(jīng)過(guò) 逆(反)轉(zhuǎn)錄逆(反)轉(zhuǎn)錄過(guò)程合成cDNA,設(shè)計(jì) 22種引物,經(jīng)RT-PCR擴(kuò)增出融合基因UBA2-WTIP.對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,推測(cè)融合基因UBA2-WTIP是在UBA2基因的第16外顯子與WTIP基因的第2外顯子處拼接而成,如圖1所示。為了驗(yàn)證該融合基因的產(chǎn)生是基因組DNA融合而不是不同的RNA剪接后逆轉(zhuǎn)錄所產(chǎn)生的,可通過(guò)PCR驗(yàn)證,其實(shí)驗(yàn)思路和預(yù)期結(jié)果為 提取該病人的DNA,使用圖中F1和R1引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,若出現(xiàn)239bp擴(kuò)增片段,該融合基因的融合方式是基因組水平融合提取該病人的DNA,使用圖中F1和R1引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,若出現(xiàn)239bp擴(kuò)增片段,該融合基因的融合方式是基因組水平融合。
(2)為了構(gòu)建重組載體,科研人員設(shè)計(jì)了以下2種引物,如圖2所示:
上游引物F:為:5'TATGGTACCATG①GCACTGTCGCGGGG3',GGTACC為KpnⅠ酶切位點(diǎn);
下游引物R為:5'TAT②TCA③GAGCTCAGTGACGTG3';
FLAG標(biāo)簽基因編碼鏈序列(5'GATTACAAGGATGACGACGATAAG3')可以插入目的基因編碼區(qū)的首端或者末端。已知引物中ATG對(duì)應(yīng)起始密碼。若UBA2-WTIP融合基因編碼的蛋白質(zhì)前端有一段信號(hào)肽,則FLAG標(biāo)簽基因序列一般不能插入①位置,原因是 蛋白質(zhì)前端的信號(hào)肽一般會(huì)在蛋白質(zhì)成熟時(shí)被切割掉,所以不能得到帶有FLAG肽鏈的蛋白質(zhì)蛋白質(zhì)前端的信號(hào)肽一般會(huì)在蛋白質(zhì)成熟時(shí)被切割掉,所以不能得到帶有FLAG肽鏈的蛋白質(zhì);若在下游引物R2②③處插入FLAG標(biāo)簽基因序列和EcoR1酶切位點(diǎn),已知引物中TCA對(duì)應(yīng)終止密碼,位置③處序列為5'CTTATCGTCGTCATCCTTGTAATCCTTATCGTCGTCATCCTTGTAATC3'。
(3)制備的重組載體體外轉(zhuǎn)染人類(lèi)白血病細(xì)胞株KG-la細(xì)胞,提取各組細(xì)胞總蛋白,用FLAG單克隆抗體檢測(cè)蛋白表達(dá)情況,并分別測(cè)定轉(zhuǎn)染空質(zhì)粒的對(duì)照細(xì)胞、轉(zhuǎn)錄UBA2-WTIP融合基因及轉(zhuǎn)錄WTIP基因的KGla細(xì)胞增殖情況,結(jié)果分別如圖3所示。
檢測(cè)相關(guān)蛋白質(zhì)是否表達(dá)的方法是 抗原-抗體雜交抗原-抗體雜交;上述生長(zhǎng)曲線(xiàn)結(jié)果說(shuō)明 UBA2-WTIP融合基因能在體外促進(jìn)白血病細(xì)胞增殖,WTIP基因能抑制白血病細(xì)胞的增殖UBA2-WTIP融合基因能在體外促進(jìn)白血病細(xì)胞增殖,WTIP基因能抑制白血病細(xì)胞的增殖。
【考點(diǎn)】基因工程的操作過(guò)程綜合;DNA片段的擴(kuò)增與電泳鑒定.
【答案】逆(反)轉(zhuǎn)錄;2;提取該病人的DNA,使用圖中F1和R1引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,若出現(xiàn)239bp擴(kuò)增片段,該融合基因的融合方式是基因組水平融合;蛋白質(zhì)前端的信號(hào)肽一般會(huì)在蛋白質(zhì)成熟時(shí)被切割掉,所以不能得到帶有FLAG肽鏈的蛋白質(zhì);CTTATCGTCGTCATCCTTGTAATC;抗原-抗體雜交;UBA2-WTIP融合基因能在體外促進(jìn)白血病細(xì)胞增殖,WTIP基因能抑制白血病細(xì)胞的增殖
【解答】
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